Protein–RNA interactions for Protein: A2AV72

Mup6, MCG140531, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mup6A2AV72 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Mup6A2AV72 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Mup6A2AV72 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Mup6A2AV72 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Mup6A2AV72 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Mup6A2AV72 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Mup6A2AV72 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Mup6A2AV72 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Mup6A2AV72 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Mup6A2AV72 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Mup6A2AV72 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Mup6A2AV72 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Mup6A2AV72 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Mup6A2AV72 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Mup6A2AV72 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Mup6A2AV72 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Mup6A2AV72 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Mup6A2AV72 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mup6A2AV72 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mup6A2AV72 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mup6A2AV72 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mup6A2AV72 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mup6A2AV72 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Mup6A2AV72 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mup6A2AV72 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mup6A2AV72 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mup6A2AV72 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Mup6A2AV72 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mup6A2AV72 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mup6A2AV72 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mup6A2AV72 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mup6A2AV72 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mup6A2AV72 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mup6A2AV72 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mup6A2AV72 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mup6A2AV72 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Mup6A2AV72 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mup6A2AV72 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mup6A2AV72 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mup6A2AV72 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mup6A2AV72 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mup6A2AV72 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mup6A2AV72 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Mup6A2AV72 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mup6A2AV72 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mup6A2AV72 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mup6A2AV72 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mup6A2AV72 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mup6A2AV72 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mup6A2AV72 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mup6A2AV72 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mup6A2AV72 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mup6A2AV72 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mup6A2AV72 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mup6A2AV72 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mup6A2AV72 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mup6A2AV72 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mup6A2AV72 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mup6A2AV72 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mup6A2AV72 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Mup6A2AV72 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mup6A2AV72 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Mup6A2AV72 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mup6A2AV72 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mup6A2AV72 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Mup6A2AV72 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mup6A2AV72 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mup6A2AV72 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mup6A2AV72 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mup6A2AV72 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mup6A2AV72 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Mup6A2AV72 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mup6A2AV72 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mup6A2AV72 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mup6A2AV72 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mup6A2AV72 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mup6A2AV72 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mup6A2AV72 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mup6A2AV72 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mup6A2AV72 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mup6A2AV72 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mup6A2AV72 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mup6A2AV72 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mup6A2AV72 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mup6A2AV72 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mup6A2AV72 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mup6A2AV72 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mup6A2AV72 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mup6A2AV72 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mup6A2AV72 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mup6A2AV72 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mup6A2AV72 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mup6A2AV72 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mup6A2AV72 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mup6A2AV72 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mup6A2AV72 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mup6A2AV72 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Mup6A2AV72 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mup6A2AV72 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mup6A2AV72 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms