Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Itga8A2ARA8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Itga8A2ARA8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Itga8A2ARA8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Itga8A2ARA8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Itga8A2ARA8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Itga8A2ARA8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Itga8A2ARA8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Itga8A2ARA8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Itga8A2ARA8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Itga8A2ARA8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Itga8A2ARA8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Itga8A2ARA8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Itga8A2ARA8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Itga8A2ARA8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Itga8A2ARA8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Itga8A2ARA8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Itga8A2ARA8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Itga8A2ARA8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Itga8A2ARA8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Itga8A2ARA8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Itga8A2ARA8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Itga8A2ARA8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Itga8A2ARA8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Itga8A2ARA8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Itga8A2ARA8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Itga8A2ARA8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Itga8A2ARA8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Itga8A2ARA8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Itga8A2ARA8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Itga8A2ARA8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Itga8A2ARA8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Itga8A2ARA8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Itga8A2ARA8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Itga8A2ARA8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Itga8A2ARA8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Itga8A2ARA8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Itga8A2ARA8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Itga8A2ARA8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Itga8A2ARA8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Itga8A2ARA8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Itga8A2ARA8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Itga8A2ARA8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Itga8A2ARA8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga8A2ARA8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Itga8A2ARA8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Itga8A2ARA8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Itga8A2ARA8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Itga8A2ARA8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Itga8A2ARA8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Itga8A2ARA8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itga8A2ARA8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Itga8A2ARA8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itga8A2ARA8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itga8A2ARA8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itga8A2ARA8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itga8A2ARA8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itga8A2ARA8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itga8A2ARA8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Itga8A2ARA8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itga8A2ARA8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Itga8A2ARA8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itga8A2ARA8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itga8A2ARA8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Itga8A2ARA8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itga8A2ARA8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Itga8A2ARA8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Itga8A2ARA8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itga8A2ARA8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itga8A2ARA8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itga8A2ARA8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Itga8A2ARA8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Itga8A2ARA8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Itga8A2ARA8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Itga8A2ARA8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Itga8A2ARA8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Itga8A2ARA8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Itga8A2ARA8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Itga8A2ARA8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Itga8A2ARA8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Itga8A2ARA8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Itga8A2ARA8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Itga8A2ARA8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Itga8A2ARA8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Itga8A2ARA8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Itga8A2ARA8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Itga8A2ARA8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Itga8A2ARA8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Itga8A2ARA8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Itga8A2ARA8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Itga8A2ARA8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Itga8A2ARA8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Itga8A2ARA8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Itga8A2ARA8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Itga8A2ARA8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Itga8A2ARA8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga8A2ARA8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga8A2ARA8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Itga8A2ARA8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itga8A2ARA8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms