Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Pkd2l1A2A259 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pkd2l1A2A259 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pkd2l1A2A259 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pkd2l1A2A259 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Pkd2l1A2A259 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Pkd2l1A2A259 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pkd2l1A2A259 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pkd2l1A2A259 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Pkd2l1A2A259 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pkd2l1A2A259 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pkd2l1A2A259 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pkd2l1A2A259 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Pkd2l1A2A259 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Pkd2l1A2A259 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pkd2l1A2A259 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pkd2l1A2A259 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pkd2l1A2A259 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pkd2l1A2A259 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pkd2l1A2A259 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pkd2l1A2A259 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Pkd2l1A2A259 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd2l1A2A259 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pkd2l1A2A259 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pkd2l1A2A259 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pkd2l1A2A259 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pkd2l1A2A259 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkd2l1A2A259 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkd2l1A2A259 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pkd2l1A2A259 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pkd2l1A2A259 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Pkd2l1A2A259 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pkd2l1A2A259 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pkd2l1A2A259 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pkd2l1A2A259 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pkd2l1A2A259 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pkd2l1A2A259 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Pkd2l1A2A259 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkd2l1A2A259 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkd2l1A2A259 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pkd2l1A2A259 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pkd2l1A2A259 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkd2l1A2A259 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pkd2l1A2A259 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pkd2l1A2A259 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pkd2l1A2A259 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pkd2l1A2A259 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pkd2l1A2A259 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pkd2l1A2A259 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pkd2l1A2A259 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pkd2l1A2A259 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pkd2l1A2A259 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkd2l1A2A259 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkd2l1A2A259 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkd2l1A2A259 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkd2l1A2A259 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkd2l1A2A259 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkd2l1A2A259 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkd2l1A2A259 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pkd2l1A2A259 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pkd2l1A2A259 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pkd2l1A2A259 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkd2l1A2A259 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkd2l1A2A259 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2l1A2A259 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2l1A2A259 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2l1A2A259 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2l1A2A259 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkd2l1A2A259 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2l1A2A259 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkd2l1A2A259 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkd2l1A2A259 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkd2l1A2A259 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkd2l1A2A259 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkd2l1A2A259 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkd2l1A2A259 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkd2l1A2A259 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkd2l1A2A259 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkd2l1A2A259 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pkd2l1A2A259 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd2l1A2A259 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd2l1A2A259 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2l1A2A259 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2l1A2A259 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkd2l1A2A259 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkd2l1A2A259 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkd2l1A2A259 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2l1A2A259 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2l1A2A259 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkd2l1A2A259 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2l1A2A259 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pkd2l1A2A259 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkd2l1A2A259 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2l1A2A259 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pkd2l1A2A259 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pkd2l1A2A259 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pkd2l1A2A259 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkd2l1A2A259 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pkd2l1A2A259 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkd2l1A2A259 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms