Protein–RNA interactions for Protein: A1E5L0

Cytl1, Cytokine-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cytl1A1E5L0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cytl1A1E5L0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cytl1A1E5L0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cytl1A1E5L0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cytl1A1E5L0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cytl1A1E5L0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cytl1A1E5L0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Cytl1A1E5L0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Cytl1A1E5L0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cytl1A1E5L0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Cytl1A1E5L0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Cytl1A1E5L0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cytl1A1E5L0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Cytl1A1E5L0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cytl1A1E5L0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cytl1A1E5L0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cytl1A1E5L0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cytl1A1E5L0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cytl1A1E5L0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cytl1A1E5L0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cytl1A1E5L0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cytl1A1E5L0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cytl1A1E5L0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cytl1A1E5L0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cytl1A1E5L0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cytl1A1E5L0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cytl1A1E5L0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cytl1A1E5L0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cytl1A1E5L0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cytl1A1E5L0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cytl1A1E5L0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cytl1A1E5L0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cytl1A1E5L0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cytl1A1E5L0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cytl1A1E5L0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cytl1A1E5L0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cytl1A1E5L0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cytl1A1E5L0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cytl1A1E5L0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cytl1A1E5L0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cytl1A1E5L0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cytl1A1E5L0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cytl1A1E5L0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cytl1A1E5L0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cytl1A1E5L0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cytl1A1E5L0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cytl1A1E5L0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cytl1A1E5L0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cytl1A1E5L0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cytl1A1E5L0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cytl1A1E5L0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cytl1A1E5L0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cytl1A1E5L0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cytl1A1E5L0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cytl1A1E5L0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cytl1A1E5L0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cytl1A1E5L0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cytl1A1E5L0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cytl1A1E5L0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cytl1A1E5L0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cytl1A1E5L0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cytl1A1E5L0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cytl1A1E5L0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cytl1A1E5L0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cytl1A1E5L0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cytl1A1E5L0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cytl1A1E5L0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cytl1A1E5L0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cytl1A1E5L0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cytl1A1E5L0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cytl1A1E5L0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cytl1A1E5L0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cytl1A1E5L0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cytl1A1E5L0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cytl1A1E5L0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cytl1A1E5L0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cytl1A1E5L0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cytl1A1E5L0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cytl1A1E5L0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cytl1A1E5L0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cytl1A1E5L0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cytl1A1E5L0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cytl1A1E5L0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cytl1A1E5L0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cytl1A1E5L0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cytl1A1E5L0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cytl1A1E5L0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cytl1A1E5L0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cytl1A1E5L0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cytl1A1E5L0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cytl1A1E5L0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cytl1A1E5L0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cytl1A1E5L0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cytl1A1E5L0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cytl1A1E5L0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cytl1A1E5L0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cytl1A1E5L0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cytl1A1E5L0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cytl1A1E5L0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cytl1A1E5L0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248 ms