Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRV1

Vmn1r82, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Vmn1r82A0A087WRV1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Vmn1r82A0A087WRV1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vmn1r82A0A087WRV1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vmn1r82A0A087WRV1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vmn1r82A0A087WRV1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Vmn1r82A0A087WRV1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Vmn1r82A0A087WRV1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Vmn1r82A0A087WRV1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vmn1r82A0A087WRV1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Vmn1r82A0A087WRV1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vmn1r82A0A087WRV1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vmn1r82A0A087WRV1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r82A0A087WRV1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vmn1r82A0A087WRV1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Vmn1r82A0A087WRV1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vmn1r82A0A087WRV1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vmn1r82A0A087WRV1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vmn1r82A0A087WRV1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vmn1r82A0A087WRV1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r82A0A087WRV1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vmn1r82A0A087WRV1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Vmn1r82A0A087WRV1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vmn1r82A0A087WRV1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vmn1r82A0A087WRV1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r82A0A087WRV1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r82A0A087WRV1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r82A0A087WRV1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn1r82A0A087WRV1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn1r82A0A087WRV1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r82A0A087WRV1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r82A0A087WRV1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r82A0A087WRV1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r82A0A087WRV1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r82A0A087WRV1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vmn1r82A0A087WRV1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r82A0A087WRV1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r82A0A087WRV1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r82A0A087WRV1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r82A0A087WRV1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r82A0A087WRV1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Vmn1r82A0A087WRV1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r82A0A087WRV1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r82A0A087WRV1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r82A0A087WRV1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r82A0A087WRV1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r82A0A087WRV1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r82A0A087WRV1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r82A0A087WRV1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r82A0A087WRV1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r82A0A087WRV1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r82A0A087WRV1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn1r82A0A087WRV1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r82A0A087WRV1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r82A0A087WRV1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r82A0A087WRV1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r82A0A087WRV1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r82A0A087WRV1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r82A0A087WRV1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn1r82A0A087WRV1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r82A0A087WRV1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r82A0A087WRV1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vmn1r82A0A087WRV1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vmn1r82A0A087WRV1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vmn1r82A0A087WRV1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn1r82A0A087WRV1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vmn1r82A0A087WRV1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r82A0A087WRV1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r82A0A087WRV1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r82A0A087WRV1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r82A0A087WRV1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r82A0A087WRV1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r82A0A087WRV1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r82A0A087WRV1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r82A0A087WRV1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn1r82A0A087WRV1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r82A0A087WRV1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r82A0A087WRV1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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