Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-4.78□□□□□ -3.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-4.82□□□□□ -3.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-4.87□□□□□ -3.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-4.88□□□□□ -3.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-4.93□□□□□ -3.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.95□□□□□ -3.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-4.95□□□□□ -3.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-5.37□□□□□ -3.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-5.37□□□□□ -3.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-5.47□□□□□ -3.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-5.65□□□□□ -3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.1 ms