Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
GINS3Q9BRX5 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
GINS3Q9BRX5 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
GINS3Q9BRX5 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
GINS3Q9BRX5 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
GINS3Q9BRX5 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
GINS3Q9BRX5 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
GINS3Q9BRX5 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
GINS3Q9BRX5 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
GINS3Q9BRX5 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
GINS3Q9BRX5 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
GINS3Q9BRX5 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-4.55□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
GINS3Q9BRX5 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
GINS3Q9BRX5 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
GINS3Q9BRX5 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
GINS3Q9BRX5 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
GINS3Q9BRX5 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
GINS3Q9BRX5 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
GINS3Q9BRX5 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
GINS3Q9BRX5 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
GINS3Q9BRX5 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
GINS3Q9BRX5 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
GINS3Q9BRX5 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
GINS3Q9BRX5 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
GINS3Q9BRX5 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
GINS3Q9BRX5 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
GINS3Q9BRX5 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
GINS3Q9BRX5 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
GINS3Q9BRX5 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
GINS3Q9BRX5 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-4.73□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-4.77□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-4.78□□□□□ -3.17
GINS3Q9BRX5 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-4.79□□□□□ -3.18
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-4.79□□□□□ -3.18
GINS3Q9BRX5 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-4.79□□□□□ -3.18
GINS3Q9BRX5 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-4.79□□□□□ -3.18
GINS3Q9BRX5 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
GINS3Q9BRX5 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
GINS3Q9BRX5 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-4.82□□□□□ -3.18
GINS3Q9BRX5 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
GINS3Q9BRX5 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.87□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-4.87□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-4.88□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-4.89□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
GINS3Q9BRX5 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
GINS3Q9BRX5 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
GINS3Q9BRX5 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
GINS3Q9BRX5 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
GINS3Q9BRX5 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-4.98□□□□□ -3.21
GINS3Q9BRX5 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-4.98□□□□□ -3.21
GINS3Q9BRX5 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
GINS3Q9BRX5 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
GINS3Q9BRX5 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
GINS3Q9BRX5 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
GINS3Q9BRX5 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
GINS3Q9BRX5 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
GINS3Q9BRX5 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.8 ms