Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PRRT1Q99946 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PRRT1Q99946 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PRRT1Q99946 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PRRT1Q99946 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PRRT1Q99946 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PRRT1Q99946 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.4 ms