Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
GRIN2AQ12879 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
GRIN2AQ12879 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-5.12□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
GRIN2AQ12879 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
GRIN2AQ12879 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.25
GRIN2AQ12879 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
GRIN2AQ12879 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
GRIN2AQ12879 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
GRIN2AQ12879 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
GRIN2AQ12879 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
GRIN2AQ12879 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
GRIN2AQ12879 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
GRIN2AQ12879 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-5.3□□□□□ -3.26
GRIN2AQ12879 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
GRIN2AQ12879 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
GRIN2AQ12879 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
GRIN2AQ12879 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
GRIN2AQ12879 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
GRIN2AQ12879 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
GRIN2AQ12879 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
GRIN2AQ12879 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
GRIN2AQ12879 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
GRIN2AQ12879 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
GRIN2AQ12879 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
GRIN2AQ12879 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
GRIN2AQ12879 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-5.41□□□□□ -3.28
GRIN2AQ12879 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
GRIN2AQ12879 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
GRIN2AQ12879 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
GRIN2AQ12879 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
GRIN2AQ12879 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
GRIN2AQ12879 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
GRIN2AQ12879 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
GRIN2AQ12879 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
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GRIN2AQ12879 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
GRIN2AQ12879 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.3
GRIN2AQ12879 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.3
GRIN2AQ12879 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
GRIN2AQ12879 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
GRIN2AQ12879 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
GRIN2AQ12879 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
GRIN2AQ12879 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
GRIN2AQ12879 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
GRIN2AQ12879 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
GRIN2AQ12879 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
GRIN2AQ12879 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
GRIN2AQ12879 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
GRIN2AQ12879 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
GRIN2AQ12879 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
GRIN2AQ12879 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
GRIN2AQ12879 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
GRIN2AQ12879 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
GRIN2AQ12879 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
GRIN2AQ12879 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
GRIN2AQ12879 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
GRIN2AQ12879 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
GRIN2AQ12879 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
GRIN2AQ12879 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-5.71□□□□□ -3.32
GRIN2AQ12879 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-5.71□□□□□ -3.32
GRIN2AQ12879 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-5.72□□□□□ -3.33
GRIN2AQ12879 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
GRIN2AQ12879 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
GRIN2AQ12879 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
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