Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
UPK3BQ9BT76 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
UPK3BQ9BT76 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
UPK3BQ9BT76 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.6□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
UPK3BQ9BT76 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
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UPK3BQ9BT76 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
UPK3BQ9BT76 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
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