Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TOP1MTQ969P6 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-2.41□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
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TOP1MTQ969P6 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
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TOP1MTQ969P6 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.53□□□□□ -2.81
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TOP1MTQ969P6 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TOP1MTQ969P6 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
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TOP1MTQ969P6 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
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TOP1MTQ969P6 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
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TOP1MTQ969P6 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TOP1MTQ969P6 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
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TOP1MTQ969P6 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TOP1MTQ969P6 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TOP1MTQ969P6 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
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