Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-6.91□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-6.91□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-6.93□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-6.93□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-6.95□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-6.96□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-6.96□□□□□ -3.52
TFF3Q07654 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-6.97□□□□□ -3.53
TFF3Q07654 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-6.98□□□□□ -3.53
TFF3Q07654 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-6.99□□□□□ -3.53
TFF3Q07654 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-7□□□□□ -3.53
TFF3Q07654 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-7.01□□□□□ -3.53
TFF3Q07654 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
TFF3Q07654 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-7.02□□□□□ -3.53
TFF3Q07654 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-7.03□□□□□ -3.53
TFF3Q07654 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-7.03□□□□□ -3.53
TFF3Q07654 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-7.04□□□□□ -3.54
TFF3Q07654 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-7.06□□□□□ -3.54
TFF3Q07654 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-7.07□□□□□ -3.54
TFF3Q07654 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-7.07□□□□□ -3.54
TFF3Q07654 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-7.07□□□□□ -3.54
TFF3Q07654 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-7.08□□□□□ -3.54
TFF3Q07654 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-7.08□□□□□ -3.54
TFF3Q07654 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-7.08□□□□□ -3.54
TFF3Q07654 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-7.08□□□□□ -3.54
TFF3Q07654 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-7.09□□□□□ -3.54
TFF3Q07654 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-7.1□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-7.12□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-7.12□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-7.12□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-7.13□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-7.13□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-7.14□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-7.14□□□□□ -3.55
TFF3Q07654 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-7.17□□□□□ -3.56
TFF3Q07654 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-7.17□□□□□ -3.56
TFF3Q07654 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-7.18□□□□□ -3.56
TFF3Q07654 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-7.18□□□□□ -3.56
TFF3Q07654 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-7.18□□□□□ -3.56
TFF3Q07654 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-7.2□□□□□ -3.56
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TFF3Q07654 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-7.23□□□□□ -3.57
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TFF3Q07654 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-7.24□□□□□ -3.57
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TFF3Q07654 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-7.26□□□□□ -3.57
TFF3Q07654 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-7.26□□□□□ -3.57
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TFF3Q07654 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-7.28□□□□□ -3.57
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TFF3Q07654 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-7.29□□□□□ -3.58
TFF3Q07654 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-7.29□□□□□ -3.58
TFF3Q07654 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-7.3□□□□□ -3.58
TFF3Q07654 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-7.32□□□□□ -3.58
TFF3Q07654 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-7.32□□□□□ -3.58
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TFF3Q07654 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-7.34□□□□□ -3.58
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TFF3Q07654 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-7.34□□□□□ -3.58
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TFF3Q07654 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-7.37□□□□□ -3.59
TFF3Q07654 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-7.37□□□□□ -3.59
TFF3Q07654 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-7.38□□□□□ -3.59
TFF3Q07654 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-7.38□□□□□ -3.59
TFF3Q07654 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-7.39□□□□□ -3.59
TFF3Q07654 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-7.39□□□□□ -3.59
TFF3Q07654 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-7.39□□□□□ -3.59
TFF3Q07654 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-7.4□□□□□ -3.59
TFF3Q07654 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-7.4□□□□□ -3.59
TFF3Q07654 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-7.41□□□□□ -3.6
TFF3Q07654 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-7.42□□□□□ -3.6
TFF3Q07654 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-7.42□□□□□ -3.6
TFF3Q07654 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-7.43□□□□□ -3.6
TFF3Q07654 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-7.46□□□□□ -3.6
TFF3Q07654 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-7.47□□□□□ -3.61
TFF3Q07654 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-7.5□□□□□ -3.61
TFF3Q07654 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-7.5□□□□□ -3.61
TFF3Q07654 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-7.51□□□□□ -3.61
TFF3Q07654 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-7.52□□□□□ -3.61
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