Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-8.94□□□□□ -3.84
PRCDQ00LT1 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-8.95□□□□□ -3.84
PRCDQ00LT1 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-8.97□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-8.98□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-8.98□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-8.99□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-8.99□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-9□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-9□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-9□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-9.01□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-9.01□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-9.01□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-9.01□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-9.02□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-9.02□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-9.02□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-9.03□□□□□ -3.85
PRCDQ00LT1 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-9.04□□□□□ -3.86
PRCDQ00LT1 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-9.05□□□□□ -3.86
PRCDQ00LT1 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-9.06□□□□□ -3.86
PRCDQ00LT1 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-9.06□□□□□ -3.86
PRCDQ00LT1 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-9.07□□□□□ -3.86
PRCDQ00LT1 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-9.08□□□□□ -3.86
PRCDQ00LT1 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-9.09□□□□□ -3.86
PRCDQ00LT1 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-9.09□□□□□ -3.86
PRCDQ00LT1 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-9.1□□□□□ -3.87
PRCDQ00LT1 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-9.11□□□□□ -3.87
PRCDQ00LT1 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-9.12□□□□□ -3.87
PRCDQ00LT1 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-9.13□□□□□ -3.87
PRCDQ00LT1 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-9.13□□□□□ -3.87
PRCDQ00LT1 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-9.13□□□□□ -3.87
PRCDQ00LT1 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-9.13□□□□□ -3.87
PRCDQ00LT1 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-9.15□□□□□ -3.87
PRCDQ00LT1 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-9.16□□□□□ -3.88
PRCDQ00LT1 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-9.16□□□□□ -3.88
PRCDQ00LT1 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-9.19□□□□□ -3.88
PRCDQ00LT1 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-9.19□□□□□ -3.88
PRCDQ00LT1 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-9.21□□□□□ -3.88
PRCDQ00LT1 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-9.21□□□□□ -3.88
PRCDQ00LT1 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-9.22□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-9.22□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-9.23□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-9.23□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-9.23□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-9.23□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-9.23□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-9.24□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-9.25□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-9.26□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-9.27□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-9.28□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-9.28□□□□□ -3.89
PRCDQ00LT1 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-9.29□□□□□ -3.9
PRCDQ00LT1 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-9.3□□□□□ -3.9
PRCDQ00LT1 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-9.32□□□□□ -3.9
PRCDQ00LT1 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-9.33□□□□□ -3.9
PRCDQ00LT1 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-9.35□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-9.36□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-9.37□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-9.37□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-9.38□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-9.38□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-9.38□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-9.38□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-9.38□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-9.39□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-9.39□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-9.4□□□□□ -3.91
PRCDQ00LT1 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-9.42□□□□□ -3.92
PRCDQ00LT1 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-9.42□□□□□ -3.92
PRCDQ00LT1 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-9.43□□□□□ -3.92
PRCDQ00LT1 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-9.43□□□□□ -3.92
PRCDQ00LT1 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-9.45□□□□□ -3.92
PRCDQ00LT1 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-9.45□□□□□ -3.92
PRCDQ00LT1 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-9.46□□□□□ -3.92
PRCDQ00LT1 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-9.47□□□□□ -3.93
PRCDQ00LT1 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-9.47□□□□□ -3.93
PRCDQ00LT1 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-9.48□□□□□ -3.93
PRCDQ00LT1 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-9.5□□□□□ -3.93
PRCDQ00LT1 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-9.5□□□□□ -3.93
PRCDQ00LT1 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-9.51□□□□□ -3.93
PRCDQ00LT1 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-9.52□□□□□ -3.93
PRCDQ00LT1 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-9.52□□□□□ -3.93
PRCDQ00LT1 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-9.54□□□□□ -3.94
PRCDQ00LT1 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-9.54□□□□□ -3.94
PRCDQ00LT1 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-9.55□□□□□ -3.94
PRCDQ00LT1 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-9.55□□□□□ -3.94
PRCDQ00LT1 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-9.56□□□□□ -3.94
PRCDQ00LT1 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-9.56□□□□□ -3.94
PRCDQ00LT1 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-9.58□□□□□ -3.94
PRCDQ00LT1 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-9.61□□□□□ -3.95
PRCDQ00LT1 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-9.62□□□□□ -3.95
PRCDQ00LT1 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-9.64□□□□□ -3.95
PRCDQ00LT1 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-9.64□□□□□ -3.95
PRCDQ00LT1 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-9.64□□□□□ -3.95
PRCDQ00LT1 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-9.65□□□□□ -3.95
PRCDQ00LT1 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-9.66□□□□□ -3.96
PRCDQ00LT1 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-9.66□□□□□ -3.96
PRCDQ00LT1 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-9.66□□□□□ -3.96
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