Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SCN5AQ14524 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SCN5AQ14524 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SCN5AQ14524 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN5AQ14524 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN5AQ14524 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN5AQ14524 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SCN5AQ14524 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SCN5AQ14524 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SCN5AQ14524 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.1 ms