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Protein–RNA interactions for Protein: O14815
CAPN9, Calpain-9, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CAPN9
O14815
RNU6-246P-201
ENST00000384702
107 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
Y_RNA.583-201
ENST00000391033
113 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
RNU6-663P-201
ENST00000391105
106 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
RNU6-1250P-201
ENST00000391218
107 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
RNU6-721P-201
ENST00000410155
105 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
RNU6-284P-201
ENST00000411105
106 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
Y_RNA.282-201
ENST00000364793
102 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
SNORA13-201
ENST00000458790
133 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
MIR3179-1-201
ENST00000578940
84 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
MIR3179-2-201
ENST00000579107
84 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
MIR3179-3-201
ENST00000579566
84 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
MIR548AZ-201
ENST00000616567
95 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
MIR3179-4-201
ENST00000617599
84 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
U4.2-201
ENST00000618561
85 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
Y_RNA.443-201
ENST00000384135
111 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
SNORA32.3-201
ENST00000384772
121 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
Y_RNA.189-201
ENST00000363959
112 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
RNU6-871P-201
ENST00000516122
100 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
RNU6-638P-201
ENST00000516582
104 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
SNORD113-2-201
ENST00000391082
72 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
RNU6-630P-201
ENST00000391258
106 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
AP000533.3-201
ENST00000447704
118 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
MIR4436A-201
ENST00000585278
85 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
SNORD114-14-201
ENST00000362723
75 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
MT-TQ-201
ENST00000387372
72 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
SNORA3B-201
ENST00000391305
131 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
SNORD30.1-201
ENST00000391309
70 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
SNORD18.2-201
ENST00000459604
70 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
AC020913.3-201
ENST00000594678
125 nt
TSL 3
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
RNU6-924P-201
ENST00000362926
108 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
MIR527-201
ENST00000385244
85 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
RNU6-542P-201
ENST00000516405
103 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
CAPN9
O14815
Y_RNA.109-201
ENST00000363215
102 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
RNU6-458P-201
ENST00000384179
107 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
RNU6-649P-201
ENST00000384463
107 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
SNORA41B-201
ENST00000384785
128 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
U6.58-201
ENST00000613107
107 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
Y_RNA.613-201
ENST00000410726
97 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
AC021146.6-201
ENST00000514659
117 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
SCARNA21.1-201
ENST00000515996
128 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
U7.5-201
ENST00000517224
61 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
AC005520.4-201
ENST00000604337
90 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
U6.111-201
ENST00000636093
83 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
SNORA25.4-201
ENST00000363666
124 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
Y_RNA.236-201
ENST00000364427
111 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
TRAJ9-201
ENST00000390528
61 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
RNU7-88P-201
ENST00000458752
63 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
RNU6-539P-201
ENST00000516665
103 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
MIR4320-201
ENST00000636981
65 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
SNORD116-16-201
ENST00000384533
92 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
MIR587-201
ENST00000384845
96 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
MIR1207-201
ENST00000408249
87 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
MIR198-201
ENST00000637333
62 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
RNU6-1296P-201
ENST00000383879
107 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
Y_RNA.484-201
ENST00000384389
103 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
CAPN9
O14815
SNORD114-17-201
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75 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
Y_RNA.413-201
ENST00000384007
102 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
Y_RNA.754-201
ENST00000476024
102 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
RNU6-1174P-201
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101 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
Y_RNA.790-201
ENST00000614282
102 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
Y_RNA.782-201
ENST00000614695
102 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
RNU6-598P-201
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105 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
RNU6-732P-201
ENST00000516033
103 nt
BASIC
-0.61
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CAPN9
O14815
RNU6-1238P-201
ENST00000517215
102 nt
BASIC
-0.61
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CAPN9
O14815
RNU6-1233P-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
RNU6-800P-201
ENST00000384473
103 nt
BASIC
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CAPN9
O14815
RNU6-92P-201
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104 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
Y_RNA.386-201
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105 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
SNORA26.4-201
ENST00000391188
123 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
MIR429-201
ENST00000362106
83 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
SNORD19-201
ENST00000391191
68 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
AC114801.3-201
ENST00000510231
177 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
RNU6-1262P-201
ENST00000516217
96 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
MIR4511-201
ENST00000582784
87 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
SNORD60.1-201
ENST00000362451
73 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
TRAJ57-201
ENST00000390482
63 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
RNU6-696P-201
ENST00000390834
107 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
SNORD63.1-201
ENST00000516178
80 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
U2.18-201
ENST00000622185
84 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
CAPN9
O14815
SNORD1B-201
ENST00000363091
84 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
AP002795.1-201
ENST00000534879
84 nt
BASIC
-0.66
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
SNORD115-33-201
ENST00000363723
82 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
SNORA25.5-201
ENST00000363782
126 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
RNA5SP192-201
ENST00000364404
120 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
RNU6-431P-201
ENST00000383874
107 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
MIR147A-201
ENST00000385079
72 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
AC103706.3-201
ENST00000636297
85 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
RNU6-10P-201
ENST00000384036
107 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
SNORD64-201
ENST00000386683
67 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
AL353691.2-201
ENST00000443795
59 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
RNU6-122P-201
ENST00000516818
107 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
MIR6738-201
ENST00000619620
64 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
SNORD114-3-201
ENST00000364969
75 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
CAPN9
O14815
SNORD114-25-201
ENST00000363742
72 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
CAPN9
O14815
MIR378F-201
ENST00000578143
78 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
CAPN9
O14815
RNU6-1267P-201
ENST00000410747
107 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
CAPN9
O14815
RNU6-172P-201
ENST00000411000
93 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
CAPN9
O14815
SPRY4-IT1_2.1-201
ENST00000612613
121 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
CAPN9
O14815
RNU6-471P-201
ENST00000383944
106 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
CAPN9
O14815
MIR548Q-201
ENST00000408404
100 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
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