Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
HMGN3Q15651 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
HMGN3Q15651 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-4.66□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
HMGN3Q15651 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-4.72□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-4.73□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-4.74□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-4.78□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-4.78□□□□□ -3.17
HMGN3Q15651 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-4.79□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-4.79□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-4.79□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-4.8□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-4.8□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-4.82□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-4.82□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.83□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
HMGN3Q15651 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
HMGN3Q15651 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
HMGN3Q15651 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
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