Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NR1I3Q14994 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NR1I3Q14994 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NR1I3Q14994 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NR1I3Q14994 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NR1I3Q14994 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NR1I3Q14994 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NR1I3Q14994 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
NR1I3Q14994 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NR1I3Q14994 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NR1I3Q14994 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NR1I3Q14994 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 465.2 ms