Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SMC1AQ14683 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SMC1AQ14683 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMC1AQ14683 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMC1AQ14683 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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