Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A3Q14050 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A3Q14050 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL9A3Q14050 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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