Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LMAN2Q12907 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LMAN2Q12907 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LMAN2Q12907 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LMAN2Q12907 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LMAN2Q12907 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LMAN2Q12907 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LMAN2Q12907 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LMAN2Q12907 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
LMAN2Q12907 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LMAN2Q12907 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LMAN2Q12907 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LMAN2Q12907 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
LMAN2Q12907 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.5 ms