Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-4.08□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
CPSF1Q10570 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
CPSF1Q10570 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CPSF1Q10570 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-4.25□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-4.27□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CPSF1Q10570 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
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