Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-7.83□□□□□ -3.66
Q9Y3F1 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-7.83□□□□□ -3.66
Q9Y3F1 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-7.84□□□□□ -3.66
Q9Y3F1 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-7.84□□□□□ -3.66
Q9Y3F1 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-7.85□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-7.85□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-7.85□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-7.85□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-7.86□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-7.86□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-7.87□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-7.87□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-7.88□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-7.88□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-7.89□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-7.89□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-7.9□□□□□ -3.67
Q9Y3F1 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-7.91□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-7.91□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-7.91□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-7.91□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-7.92□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-7.92□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-7.92□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-7.94□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-7.94□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-7.94□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-7.94□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-7.95□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-7.95□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-7.95□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-7.96□□□□□ -3.68
Q9Y3F1 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-7.97□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-7.97□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-7.97□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-7.99□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-7.99□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-7.99□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-8□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-8□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-8□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-8□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-8.01□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-8.02□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-8.02□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-8.02□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-8.02□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-8.02□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-8.02□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-8.02□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-8.02□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-8.02□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-8.03□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-8.03□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-8.03□□□□□ -3.69
Q9Y3F1 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC-8.04□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-8.04□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-8.04□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-8.05□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-8.07□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-8.07□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-8.08□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-8.08□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-8.08□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-8.09□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-8.09□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-8.09□□□□□ -3.7
Q9Y3F1 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-8.1□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-8.1□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-8.1□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-8.1□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-8.11□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-8.12□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-8.12□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-8.12□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-8.13□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-8.14□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-8.14□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-8.15□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-8.15□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-8.15□□□□□ -3.71
Q9Y3F1 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-8.18□□□□□ -3.72
Q9Y3F1 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-8.18□□□□□ -3.72
Q9Y3F1 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-8.18□□□□□ -3.72
Q9Y3F1 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-8.21□□□□□ -3.72
Q9Y3F1 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-8.21□□□□□ -3.72
Q9Y3F1 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-8.21□□□□□ -3.72
Q9Y3F1 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-8.22□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-8.22□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-8.22□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-8.23□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-8.23□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-8.23□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-8.23□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-8.23□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-8.24□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-8.24□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-8.24□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-8.24□□□□□ -3.73
Q9Y3F1 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-8.24□□□□□ -3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms