Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CACNA1CQ13936 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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