Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SHROOM2Q13796 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
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SHROOM2Q13796 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHROOM2Q13796 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHROOM2Q13796 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHROOM2Q13796 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHROOM2Q13796 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
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SHROOM2Q13796 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
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SHROOM2Q13796 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHROOM2Q13796 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHROOM2Q13796 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHROOM2Q13796 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SHROOM2Q13796 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
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SHROOM2Q13796 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SHROOM2Q13796 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
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SHROOM2Q13796 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
SHROOM2Q13796 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
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SHROOM2Q13796 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
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SHROOM2Q13796 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHROOM2Q13796 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
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