Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CHD3Q12873 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CHD3Q12873 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CHD3Q12873 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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