Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-5.77□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-5.77□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-5.78□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-5.78□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-5.78□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-5.79□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-5.84□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-5.84□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-5.86□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-5.87□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-5.87□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-5.87□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-5.87□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-5.88□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-5.88□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-5.89□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-5.89□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-5.89□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-5.91□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-5.91□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-5.93□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-5.93□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-5.93□□□□□ -3.36
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TFF3Q07654 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-5.93□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-5.93□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-5.94□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-5.95□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-5.95□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-5.98□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-5.98□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-5.98□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-6□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-6□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-6□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-6□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-6.01□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-6.02□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-6.02□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-6.02□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-6.02□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-6.04□□□□□ -3.38
TFF3Q07654 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-6.04□□□□□ -3.38
TFF3Q07654 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-6.04□□□□□ -3.38
TFF3Q07654 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-6.04□□□□□ -3.38
TFF3Q07654 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-6.04□□□□□ -3.38
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