Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VPREB3Q9UKI3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VPREB3Q9UKI3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VPREB3Q9UKI3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VPREB3Q9UKI3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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VPREB3Q9UKI3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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VPREB3Q9UKI3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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VPREB3Q9UKI3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPREB3Q9UKI3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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