Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C4orf46Q504U0 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C4orf46Q504U0 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C4orf46Q504U0 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C4orf46Q504U0 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C4orf46Q504U0 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C4orf46Q504U0 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C4orf46Q504U0 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C4orf46Q504U0 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C4orf46Q504U0 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C4orf46Q504U0 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C4orf46Q504U0 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C4orf46Q504U0 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C4orf46Q504U0 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C4orf46Q504U0 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C4orf46Q504U0 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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C4orf46Q504U0 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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C4orf46Q504U0 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
C4orf46Q504U0 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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C4orf46Q504U0 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C4orf46Q504U0 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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