Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.53□□□□□ -2.81
NEDD8Q15843 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
NEDD8Q15843 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.62□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms