Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NR1I3Q14994 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NR1I3Q14994 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NR1I3Q14994 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 418.6 ms