Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKP1Q13835 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKP1Q13835 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKP1Q13835 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKP1Q13835 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKP1Q13835 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKP1Q13835 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKP1Q13835 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKP1Q13835 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PKP1Q13835 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PKP1Q13835 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PKP1Q13835 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PKP1Q13835 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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