Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.2 ms