Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PDE3BQ13370 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE3BQ13370 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PDE3BQ13370 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PDE3BQ13370 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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