Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXF1Q12946 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
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FOXF1Q12946 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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FOXF1Q12946 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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FOXF1Q12946 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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FOXF1Q12946 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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