Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HOXA4Q00056 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
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HOXA4Q00056 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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HOXA4Q00056 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HOXA4Q00056 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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HOXA4Q00056 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HOXA4Q00056 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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HOXA4Q00056 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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HOXA4Q00056 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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HOXA4Q00056 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXA4Q00056 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXA4Q00056 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXA4Q00056 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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