Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
EHD3Q9NZN3 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
EHD3Q9NZN3 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
EHD3Q9NZN3 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
EHD3Q9NZN3 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
EHD3Q9NZN3 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EHD3Q9NZN3 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
EHD3Q9NZN3 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.2 ms