Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
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TMEM260Q9NX78 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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