Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PDGFDQ9GZP0 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDGFDQ9GZP0 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDGFDQ9GZP0 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDGFDQ9GZP0 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDGFDQ9GZP0 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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