Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCSER1Q9C0I3 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCSER1Q9C0I3 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCSER1Q9C0I3 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCSER1Q9C0I3 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CCSER1Q9C0I3 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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