Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATG4CQ96DT6 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATG4CQ96DT6 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.5 ms