Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
VSTM4Q8IW00 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VSTM4Q8IW00 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VSTM4Q8IW00 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.9 ms