Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RNF20Q5VTR2 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RNF20Q5VTR2 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RNF20Q5VTR2 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RNF20Q5VTR2 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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