Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKN1Q16512 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PKN1Q16512 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PKN1Q16512 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PKN1Q16512 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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