Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
USF2Q15853 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
USF2Q15853 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
USF2Q15853 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
USF2Q15853 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
USF2Q15853 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
USF2Q15853 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
USF2Q15853 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
USF2Q15853 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
USF2Q15853 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
USF2Q15853 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
USF2Q15853 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
USF2Q15853 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
USF2Q15853 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
USF2Q15853 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
USF2Q15853 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
USF2Q15853 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
USF2Q15853 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
USF2Q15853 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
USF2Q15853 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
USF2Q15853 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
USF2Q15853 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
USF2Q15853 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
USF2Q15853 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
USF2Q15853 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
USF2Q15853 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
USF2Q15853 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
USF2Q15853 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
USF2Q15853 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USF2Q15853 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USF2Q15853 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USF2Q15853 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
USF2Q15853 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
USF2Q15853 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
USF2Q15853 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
USF2Q15853 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
USF2Q15853 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
USF2Q15853 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
USF2Q15853 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
USF2Q15853 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
USF2Q15853 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
USF2Q15853 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
USF2Q15853 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
USF2Q15853 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
USF2Q15853 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
USF2Q15853 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
USF2Q15853 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
USF2Q15853 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
USF2Q15853 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
USF2Q15853 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
USF2Q15853 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
USF2Q15853 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
USF2Q15853 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
USF2Q15853 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
USF2Q15853 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
USF2Q15853 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
USF2Q15853 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
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