Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
UBQLN4Q9NRR5 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
UBQLN4Q9NRR5 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
UBQLN4Q9NRR5 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
UBQLN4Q9NRR5 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
UBQLN4Q9NRR5 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
UBQLN4Q9NRR5 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
UBQLN4Q9NRR5 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
UBQLN4Q9NRR5 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
UBQLN4Q9NRR5 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
UBQLN4Q9NRR5 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.2 ms