Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PRRT1Q99946 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms