Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CCDC47Q96A33 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.48□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CCDC47Q96A33 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CCDC47Q96A33 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
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