Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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DDB1Q16531 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
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DDB1Q16531 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DDB1Q16531 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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