Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SNCBQ16143 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SNCBQ16143 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SNCBQ16143 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-2.03□□□□□ -2.73
SNCBQ16143 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SNCBQ16143 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SNCBQ16143 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SNCBQ16143 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.15□□□□□ -2.75
SNCBQ16143 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNCBQ16143 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNCBQ16143 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNCBQ16143 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNCBQ16143 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNCBQ16143 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNCBQ16143 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNCBQ16143 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.9 ms