Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NKX1-1Q15270 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NKX1-1Q15270 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NKX1-1Q15270 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NKX1-1Q15270 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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