Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
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SNX17Q15036 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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SNX17Q15036 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNX17Q15036 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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SNX17Q15036 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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SNX17Q15036 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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SNX17Q15036 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNX17Q15036 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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